故事发生在尼布尔海姆事件之后，神罗公司为了掩盖真相，派遣由扎克斯与克劳德率领的特种兵小队执行一项名为“终极指令”的绝密任务：肃清所有知晓魔晄能源核心秘密的科学家与目击者。然而，当扎克斯在任务途中遭遇一位濒死的古代种后裔时，他意识到自己要猎杀的并非叛徒，而是试图唤醒星球“武器”的拯救者。面对神罗的谎言、战友的倒戈以及体内细胞逐渐失控的危机，扎克斯必须在“军人天职”与“守护星球”之间做出最终选择。一场从米德加魔晄炉到遗忘之都的亡命狂奔就此展开。
作为游戏粉丝向作品，动作场面流畅度惊人，扎克斯的最后战役被重新演绎得悲壮而热血。影片成功补全了正传中的空白，将“英雄”的定义从力量拉回到了“选择”上。虽然节奏略显紧凑，但情感的爆发力极强。
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